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目前，德国地下水中硝酸盐污染严重，这主要是由于农业施肥监管不严造成的。由于要求德国自来水达到直饮水的质量，自来水厂的净水成本将明显增加，公众承担的成本也将增加。德国《世界报》报道称，污染超出了人们的预期，使得水资源处理变得更加困难和昂贵，导致自来水价格大幅上涨。
德国有6000多家自来水供应公司，其水源主要来自河流、湖泊和地下水。近年来，供水商一直在将重污染水与低污染水混合，以将水源的污染浓度降低到水净化设施可以处理的范围内。然而，德国农民一直在田间施用大量肥料以提高作物产量，并直接向田间排放矿物肥料和粪肥，导致地下水硝酸盐，即氮和磷的过度污染。随着污染的加剧，供水企业必须修建新的取水渠道或进一步开发净水设施。德国水与能源联合会主席马丁·威汉德(Martin Wiehande)直言不讳地表示，“这将是一个非常昂贵的项目”，额外的成本必须由用户分担，因此水价大幅上涨是不可避免的。根据该协会的计算，在污染严重的地区，水费将增加62%，这意味着一个三口之家的年平均自来水费用将从大约217欧元(1欧元相当于7.8元人民币)增加到352欧元。
土壤中的硝酸盐能促进植物的生长。然而，一旦硝酸盐过量，不能被植物完全吸收，就会渗入地下水，其降解产物亚硝酸盐会损害水质，影响水生生物的生物多样性。根据欧盟委员会获得的数据，如果硝酸盐浓度超过每升水50毫克，将对人类健康产生明显的负面影响，特别是对孕妇和婴儿。
为了检测水质，德国将每50公里建立一个水质监测站，仅柏林就有180个监测站。2012年，欧洲联盟通过对162个德国监测站的测量得出结论，德国地下水硝酸盐污染严重。2016年底，欧盟再次发布调查报告，称德国地下水中的硝酸盐含量在过去几年没有明显改善，三分之一地区的硝酸盐含量严重超过50毫克/升的上限，甚至农田附近出现了400毫克/升的重度污染区。2016年11月，欧盟起诉德国违反欧盟硝酸盐指令，指出德国地下水被农牧业生产的硝酸盐成分污染，并责令德国及时整改，否则将处以巨额罚款。
虽然德国联邦政府和地方政府之前已经颁布了“施肥规则”计划，但它尚未作为一项全国性法律生效，更多地依赖于当地农民的“自觉执行”。为了解决地下水中硝酸盐含量过高的问题，德国环境部和农业部联合发布了国家法令“硝酸盐红色警戒区”，将重污染地区划为“红色警戒区”，严格管理农业施肥，并责令相关地区改善水质。该法律将于2019年正式实施。
德国环境部长芭芭拉·亨德里克斯(Barbara Hendricks)指出，过度施肥不仅会破坏水域的生物多样性，增加净水处理的负担，还会增加农业成本。加强对工业施肥的监管符合各方的共同利益。然而，德国农民协会主席约阿希姆·卢克瓦德说，过分强调地下水中过量硝酸盐的危害是“危言耸听”。对此，魏延德指出，地下水受到污染是不可否认的事实。“尽管德国的供水商无论如何都会保证自来水的产出质量，但消费者不应该为农业的失误买单。”
